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Banco de DNA do Herbário Dimitri Sucre Benjamin

Bancos de DNA são depósitos de diversidade genética, que pode ser explorada através das ferramentas da biologia molecular, para produzir pesquisas taxonômicas, de estrutura genética de populações, de filogenia molecular e filogeografia, servindo ainda para orientar as atividades de coleta de germoplasma para conservação ex situ ou estabelecer áreas prioritárias para conservação in situ. Esses dados, somados à informações ecológicas, geram conhecimentos que subsidiam a proposição de medidas conservacionistas de espécies e ecossistemas ameaçados. Bancos de DNA representam também uma nova abordagem para a preservação da memória genética das espécies, que pode ser explorada hoje, ou futuramente, para a bioprospecção de genes envolvidos na produção de características e/ou processos de importância biotecnológica.

Responsáveis pelas coleções

Curadora assistente: Dra. Luciana Ozório Franco (CV lattes)

Curadora: Dra. Rafaela Campostrini Forzza (CV lattes)

Acesso aos dados do Banco de DNA

Os dados do Herbário RB podem ser acessados de duas formas:

Licença de uso dos dados do Herbário

Os dados referentes à coleções do Herbário RB estão disponíveis sobre a licença Open Data Commons Attribution License (ODC - By). Seu uso é livre desde que citada sua fonte e atribuídos os créditos ao Instituto de Pesquisas do Jardim Botânico do Rio de Janeiro.

Dados Relacionados

O Sistema JABOT foi idealizado para lidar com um conjunto de dados maior do que apresentado aqui. Entretanto, esta lista de atributos corresponde à uma tabela que consolida dados de várias tabelas do esquema nativo do JABOT, que visa atender a demanda por publicação dos dados no padrão Darwin Core para consumo, via DIGIR/TAPIR/IPT.

Atributo (Darwin Core) Descrição Nome do Termo (JABOT) Publicado IPT
Ocorrência Darwin Core Registro de origem type Natureza da amostra sim
rights Creative Commons  sim
rightsHolder Código da instituição de origem  sim
bibliographicCitation Herbário Virtual REFLORA + URL não
modified Data da última modificação  sim
institutionCode Código da instituição de origem  sim
collectionCode Acrônimo do herbário de origem  collectionconde sim
Ocorrência catalogNumber Código de barras  Identificador da Ocorrência sim
occurrenceID ID da ocorrência Identificador único sim
occurrenceRemarks Observações gerais  não
recordNumber Número do coletor No. do Coletor sim
recordedBy Nome do coletor e coletores adicionais separados por ;   Coletor sim
otherCatalogNumbers Código de barras de duplicatas associadas separadas por barra vertical  não
Evento de coleta eventDate  Data da coleta Data da coleta sim
year   Ano da Coleta sim
month   Mês da Coleta sim
day Dia da Coleta sim
verbatimEventDate Data da coleta literal data literal sim
fieldNotes Descrições da planta  Notas de Campo sim
eventRemarks Nome e observações da expedição  não
fieldNumber Número da expedição  sim
Local de coleta country Nome do país País sim
countryCode ISO 3166-1-alpha-2 código da país  não
stateProvince Estado Estado sim
municipality Município Cidade sim
locality Local  Localidade Original sim
minimumElevationInMeters Elevação mínima em metros não
maximumElevationInMeters Elevação máxima em metros não
verbatimLatitude Latitude transcrita  Latitude Original não
verbatimLongitude Longitude transcrita Longitude Original não
decimalLatitude Latitudes decimal  sim1)
decimalLongitude Longitude decimal  sim2)
Determinação identifiedBy Determinador  Autor da Determinação sim
dateIdentified Data da determinação (DD/MM/YYY) Data da determinação sim
identificationRemarks Observações da determinação  não
identificationQualifier Qualificação da determinação (cf., aff. ou !) não
typeStatus Categoria de typus Status do Tipo sim
Taxon scientificName Nome científico completo Nome Científico sim
kingdom Reino  Reino não
family Família botânica  Família sim
genus Gênero  Gênero sim
specificEpithet Epíteto específico Espécie sim
infraspecificEpithet Epíteto intraespecífico  Infraespécie sim
taxonRank Classificação de taxon  não
scientificNameAuthorship Nome do autor da espécie  Autor da Espécie sim
Histórico de determinação Darwin Core Determinação identifiedBy Determinador Autor da Determinação não
dateIdentified identification date (DD/MM/YYY)  Data da Determinação não
identificationRemarks Observações da determinação não
identificationQualifier Qualificação da determinação (cf., aff. ou !) não
typeStatus Categoria do typus Status do Tipo não
Taxon scientificName Nome científico completo  Nome Científico não
kingdom Reino  Reino não
family Família botânica  Família não
genus Gênero  Gênero não
specificEpithet Epíteto específico  Espécie não
infraspecificEpithet Epíteto intraespecífico Infraespécie não
taxonRank Classificação de taxon  não
scientificNameAuthorship Nome do autor da espécie Autor da Espécie não
Extensão germoplasma Darwin Core Archive Adesão germoplasma germplasmID Identificador da coleção  não
storageCondition Método de preservação não
Duplicata de segurança safetyDuplicationID Acrônimo da coleção de destino não
safetyDuplicationDate Data de envio da duplicata não
1) , 2)
Não oferecido para espécies ameaçadas e no anexo I do CITES (ver lista)
colecoes/dna.1427377919.txt.gz · Última modificação: 2015/04/28 14:53 (edição externa)