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Bancos de DNA são depósitos de diversidade genética, que pode ser explorada através das ferramentas da biologia molecular, para produzir pesquisas taxonômicas, de estrutura genética de populações, de filogenia molecular e filogeografia, servindo ainda para orientar as atividades de coleta de germoplasma para conservação ex situ ou estabelecer áreas prioritárias para conservação in situ. Esses dados, somados à informações ecológicas, geram conhecimentos que subsidiam a proposição de medidas conservacionistas de espécies e ecossistemas ameaçados. Bancos de DNA representam também uma nova abordagem para a preservação da memória genética das espécies, que pode ser explorada hoje, ou futuramente, para a bioprospecção de genes envolvidos na produção de características e/ou processos de importância biotecnológica.
Curadora assistente: Dra. Luciana Ozório Franco (CV lattes)
Curadora: Dra. Rafaela Campostrini Forzza (CV lattes)
Os dados do Herbário RB podem ser acessados de duas formas:
Os dados referentes à coleções do Herbário RB estão disponíveis sobre a licença Open Data Commons Attribution License (ODC - By). Seu uso é livre desde que citada sua fonte e atribuídos os créditos ao Instituto de Pesquisas do Jardim Botânico do Rio de Janeiro.
O Sistema JABOT foi idealizado para lidar com um conjunto de dados maior do que apresentado aqui. Entretanto, esta lista de atributos corresponde à uma tabela que consolida dados de várias tabelas do esquema nativo do JABOT, que visa atender a demanda por publicação dos dados no padrão Darwin Core para consumo, via DIGIR/TAPIR/IPT.
Classe de atributo | Atributo (Darwin Core) | Descrição | Domínio | Nome do Termo (JABOT) | Publicado IPT | |
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Ocorrência Darwin Core | Registro de origem | type | Natureza da amostra | Collection | sim | |
rights | Creative Commons | CC By - Open Data Commons Attribution License | sim | |||
rightsHolder | Código da instituição de origem | Rio de Janeiro Botanical Garden Herbarium Collection (JBRJ) | sim | |||
bibliographicCitation | Herbário Virtual REFLORA + URL | não | ||||
modified | Data da última modificação | sim | ||||
institutionCode | Código da instituição de origem | e.g. “RB”; “K” | sim | |||
collectionCode | Acrônimo do herbário de origem | collectionconde | sim | |||
Ocorrência | catalogNumber | Código de barras | Identificador da Ocorrência | sim | ||
occurrenceID | ID da ocorrência | urn:catalog:JBRJ:RBdna:“código de barras” | Identificador único | sim | ||
occurrenceRemarks | Observações gerais | não | ||||
recordNumber | Número do coletor | No. do Coletor | sim | |||
recordedBy | Nome do coletor e coletores adicionais separados por ; | Coletor | sim | |||
otherCatalogNumbers | Código de barras de duplicatas associadas separadas por barra vertical | não | ||||
Evento de coleta | eventDate | Data da coleta | Data da coleta | sim | ||
year | Ano da Coleta | sim | ||||
month | Mês da Coleta | sim | ||||
day | Dia da Coleta | sim | ||||
verbatimEventDate | Data da coleta literal | e.g. “verão 1970”; “janeiro de 2010”; “1999-03-XX” | data literal | sim | ||
fieldNotes | Descrições da planta | Notas de Campo | sim | |||
eventRemarks | Observações sobre a expedição | Observações da expedição | não | |||
fieldNumber | Número da expedição | sim | ||||
Local de coleta | country | Nome do país | País | sim | ||
countryCode | ISO 3166-1-alpha-2 código da país | e.g. “BR” | não | |||
stateProvince | Estado | Estado | sim | |||
municipality | Município | Cidade | sim | |||
locality | Local | Localidade Original | sim | |||
minimumElevationInMeters | Elevação mínima em metros | não | ||||
maximumElevationInMeters | Elevação máxima em metros | não | ||||
verbatimLatitude | Latitude transcrita | Latitude Original | não | |||
verbatimLongitude | Longitude transcrita | Longitude Original | não | |||
decimalLatitude | Latitudes decimal | sim1) | ||||
decimalLongitude | Longitude decimal | sim2) | ||||
Determinação | identifiedBy | Determinador | Autor da Determinação | sim | ||
dateIdentified | Data da determinação (DD/MM/YYY) | Data da determinação | sim | |||
identificationRemarks | Observações da determinação | sim | ||||
identificationQualifier | Qualificação da determinação (cf., aff. ou !) | sim | ||||
typeStatus | Categoria de typus | {Cotipo, Epitipo, Fototipo, Fragmento de Tipo, Holotipo, Isolectotipo, Isoneotipo, Isoparatipo, Isosintipo, Isotipo, Lectoparatipo, Lectotipo, Neotipo, Paratipo, Possível Isotipo, Possível Tipo, Sintipo, Tipo, Topotipo} | Status do Tipo | sim | ||
Taxon | scientificName | Nome científico completo | Nome Científico | sim | ||
family | Família botânica | Família | sim | |||
genus | Gênero | Gênero | sim | |||
specificEpithet | Epíteto específico | Espécie | sim | |||
infraspecificEpithet | Epíteto intraespecífico | Infraespécie | sim | |||
taxonRank | Taxon do último nome mais espefífico no nome cinetífico | e.g. “subespécie”, “espécie”, “gênero”, “variedade” | Último taxon | sim | ||
scientificNameAuthorship | Nome do autor da espécie | Autor da Espécie | sim | |||
Extensão germoplasma Darwin Core Archive | Adesão germoplasma | Identificador da coleção | não | |||
storageCondition | Método de preservação | e.g. 10; 11; 12 referente à FAO\IPGRI | não | |||
Duplicata de segurança | safetyDuplicationID | Acrônimo da coleção de destino | não | |||
safetyDuplicationDate | Data de envio da duplicata | não |