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Bancos de DNA são depósitos de diversidade genética, que pode ser explorada através das ferramentas da biologia molecular, para produzir pesquisas taxonômicas, de estrutura genética de populações, de filogenia molecular e filogeografia, servindo ainda para orientar as atividades de coleta de germoplasma para conservação ex situ ou estabelecer áreas prioritárias para conservação in situ. Esses dados, somados à informações ecológicas, geram conhecimentos que subsidiam a proposição de medidas conservacionistas de espécies e ecossistemas ameaçados. Bancos de DNA representam também uma nova abordagem para a preservação da memória genética das espécies, que pode ser explorada hoje, ou futuramente, para a bioprospecção de genes envolvidos na produção de características e/ou processos de importância biotecnológica.
Curadora assistente: Dra. Luciana Ozório Franco (CV lattes)
Curadora: Dra. Rafaela Campostrini Forzza (CV lattes)
Os dados do Banco de DNA podem ser acessados de duas formas:
Os dados referentes à coleções do Herbário RB estão disponíveis sobre a licença Open Data Commons Attribution License (ODC - By). Seu uso é livre desde que citada sua fonte e atribuídos os créditos ao Instituto de Pesquisas do Jardim Botânico do Rio de Janeiro.
O Sistema JABOT foi idealizado para lidar com um conjunto de dados maior do que apresentado aqui. Entretanto, esta lista de atributos corresponde à uma tabela que consolida dados de várias tabelas do esquema nativo do JABOT, que visa atender a demanda por publicação dos dados no padrão Darwin Core para consumo, via DIGIR/TAPIR/IPT.
Atributo (Darwin Core) | Descrição | Nome do Termo (JABOT) | Publicado IPT | ||
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Ocorrência Darwin Core | Registro de origem | type | Natureza da amostra | sim | |
rights | Creative Commons | sim | |||
rightsHolder | Código da instituição de origem | sim | |||
bibliographicCitation | Herbário Virtual REFLORA + URL | não | |||
modified | Data da última modificação | sim | |||
institutionCode | Código da instituição de origem | sim | |||
collectionCode | Acrônimo do herbário de origem | collectionconde | sim | ||
Ocorrência | catalogNumber | Código de barras | Identificador da Ocorrência | sim | |
occurrenceID | ID da ocorrência | Identificador único | sim | ||
occurrenceRemarks | Observações gerais | sim | |||
recordNumber | Número do coletor | No. do Coletor | sim | ||
recordedBy | Nome do coletor e coletores adicionais separados por ; | Coletor | sim | ||
otherCatalogNumbers | Código de barras de duplicatas associadas separadas por barra vertical | não | |||
Evento de coleta | eventDate | Data da coleta | Data da coleta | sim | |
year | Ano da Coleta | sim | |||
month | Mês da Coleta | sim | |||
day | Dia da Coleta | sim | |||
verbatimEventDate | Data da coleta literal | data literal | sim | ||
fieldNotes | Descrições da planta | Notas de Campo | sim | ||
eventRemarks | Nome e observações da expedição | não | |||
fieldNumber | Número da expedição | sim | |||
Local de coleta | country | Nome do país | País | sim | |
countryCode | ISO 3166-1-alpha-2 código da país | não | |||
stateProvince | Estado | Estado | sim | ||
municipality | Município | Cidade | sim | ||
locality | Local | Localidade Original | sim | ||
minimumElevationInMeters | Elevação mínima em metros | não | |||
maximumElevationInMeters | Elevação máxima em metros | não | |||
verbatimLatitude | Latitude transcrita | Latitude Original | não | ||
verbatimLongitude | Longitude transcrita | Longitude Original | não | ||
decimalLatitude | Latitudes decimal | sim1) | |||
decimalLongitude | Longitude decimal | sim2) | |||
Determinação | identifiedBy | Determinador | Autor da Determinação | sim | |
dateIdentified | Data da determinação (DD/MM/YYY) | Data da determinação | sim | ||
identificationRemarks | Observações da determinação | não | |||
identificationQualifier | Qualificação da determinação (cf., aff. ou !) | não | |||
typeStatus | Categoria de typus | Status do Tipo | sim | ||
Taxon | scientificName | Nome científico completo | Nome Científico | sim | |
kingdom | Reino | Reino | não | ||
family | Família botânica | Família | sim | ||
genus | Gênero | Gênero | sim | ||
specificEpithet | Epíteto específico | Espécie | sim | ||
infraspecificEpithet | Epíteto intraespecífico | Infraespécie | sim | ||
taxonRank | Classificação de taxon | não | |||
scientificNameAuthorship | Nome do autor da espécie | Autor da Espécie | sim | ||
Histórico de determinação Darwin Core Archive | Determinação | identifiedBy | Determinador | Autor da Determinação | não |
dateIdentified | identification date (DD/MM/YYY) | Data da Determinação | não | ||
identificationRemarks | Observações da determinação | não | |||
identificationQualifier | Qualificação da determinação (cf., aff. ou !) | não | |||
typeStatus | Categoria do typus | Status do Tipo | não | ||
Taxon | scientificName | Nome científico completo | Nome Científico | não | |
kingdom | Reino | Reino | não | ||
family | Família botânica | Família | não | ||
genus | Gênero | Gênero | não | ||
specificEpithet | Epíteto específico | Espécie | não | ||
infraspecificEpithet | Epíteto intraespecífico | Infraespécie | não | ||
taxonRank | Classificação de taxon | não | |||
scientificNameAuthorship | Nome do autor da espécie | Autor da Espécie | não | ||
Extensão germoplasma Darwin Core Archive | Adesão germoplasma | germplasmID | Identificador da coleção | não | |
storageCondition | Método de preservação | não | |||
Duplicata de segurança | safetyDuplicationID | Acrônimo da coleção de destino | não | ||
safetyDuplicationDate | Data de envio da duplicata | não |