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O Banco de DNA de Espécies da Flora Brasileira do Jardim Botânico do Rio de Janeiro busca conservar informação genética representativa da alta diversidade da flora brasileira, sendo um registro histórico da variação vegetal e uma base para a conservação e para a biotecnologia.
O principal critério para inclusão de amostras nessa coleção é que sejam provenientes da flora nativa brasileira e que se encaixem em uma ou mais das categorias listadas abaixo:
Curadora: Dra. Luciana Ozório Franco (CV lattes)
Os dados do Banco de DNA podem ser acessados de duas formas:
Os dados referentes à coleções do Herbário RB estão disponíveis sobre a licença Open Data Commons Attribution License (ODC - By). Seu uso é livre desde que citada sua fonte e atribuídos os créditos ao Instituto de Pesquisas do Jardim Botânico do Rio de Janeiro.
O Sistema JABOT foi idealizado para lidar com um conjunto de dados maior do que apresentado aqui. Entretanto, esta lista de atributos corresponde à uma tabela que consolida dados de várias tabelas do esquema nativo do JABOT, que visa atender a demanda por publicação dos dados no padrão Darwin Core para consumo, via DIGIR/TAPIR/IPT.
Atributo (Darwin Core) | Descrição | Nome do Termo (JABOT) | Publicado IPT | ||
---|---|---|---|---|---|
Ocorrência Darwin Core | Registro de origem | type | Natureza da amostra | sim | |
basisOfRecord | Natureza específica do registro | sim | |||
rights | Creative Commons | sim | |||
rightsHolder | Código da instituição de origem | sim | |||
bibliographicCitation | Herbário Virtual REFLORA + URL | não | |||
modified | Data da última modificação | sim | |||
institutionCode | Código da instituição de origem | sim | |||
collectionCode | Acrônimo do herbário de origem | collectionconde | sim | ||
Ocorrência | catalogNumber | Código de barras | Identificador da Ocorrência | sim | |
occurrenceID | ID da ocorrência | Identificador único | sim | ||
occurrenceRemarks | Observações gerais | sim | |||
recordNumber | Número do coletor | No. do Coletor | sim | ||
recordedBy | Nome do coletor e coletores adicionais separados por ; | Coletor | sim | ||
otherCatalogNumbers | Código de barras de duplicatas associadas separadas por barra vertical | não | |||
Evento de coleta | eventDate | Data da coleta | Data da coleta | sim | |
year | Ano da Coleta | sim | |||
month | Mês da Coleta | sim | |||
day | Dia da Coleta | sim | |||
verbatimEventDate | Data da coleta literal | data literal | sim | ||
fieldNotes | Descrições da planta | Notas de Campo | sim | ||
eventRemarks | Nome e observações da expedição | não | |||
fieldNumber | Número da expedição | sim | |||
Local de coleta | country | Nome do país | País | sim | |
countryCode | ISO 3166-1-alpha-2 código da país | não | |||
stateProvince | Estado | Estado | sim | ||
municipality | Município | Cidade | sim | ||
locality | Local | Localidade Original | sim | ||
minimumElevationInMeters | Elevação mínima em metros | não | |||
maximumElevationInMeters | Elevação máxima em metros | não | |||
verbatimLatitude | Latitude transcrita | Latitude Original | não | ||
verbatimLongitude | Longitude transcrita | Longitude Original | não | ||
decimalLatitude | Latitudes decimal | sim1) | |||
decimalLongitude | Longitude decimal | sim2) | |||
Determinação | identifiedBy | Determinador | Autor da Determinação | sim | |
dateIdentified | Data da determinação (DD/MM/YYY) | Data da determinação | sim | ||
identificationRemarks | Observações da determinação | não | |||
identificationQualifier | Qualificação da determinação (cf., aff. ou !) | não | |||
typeStatus | Categoria de typus | Status do Tipo | sim | ||
Taxon | scientificName | Nome científico completo | Nome Científico | sim | |
kingdom | Reino | Reino | não | ||
family | Família botânica | Família | sim | ||
genus | Gênero | Gênero | sim | ||
specificEpithet | Epíteto específico | Espécie | sim | ||
infraspecificEpithet | Epíteto intraespecífico | Infraespécie | sim | ||
taxonRank | Classificação de taxon | não | |||
scientificNameAuthorship | Nome do autor da espécie | Autor da Espécie | sim | ||
Histórico de determinação Darwin Core Archive | Determinação | identifiedBy | Determinador | Autor da Determinação | não |
dateIdentified | identification date (DD/MM/YYY) | Data da Determinação | não | ||
identificationRemarks | Observações da determinação | não | |||
identificationQualifier | Qualificação da determinação (cf., aff. ou !) | não | |||
typeStatus | Categoria do typus | Status do Tipo | não | ||
Taxon | scientificName | Nome científico completo | Nome Científico | não | |
kingdom | Reino | Reino | não | ||
family | Família botânica | Família | não | ||
genus | Gênero | Gênero | não | ||
specificEpithet | Epíteto específico | Espécie | não | ||
infraspecificEpithet | Epíteto infraespecífico | Infraespécie | não | ||
taxonRank | Classificação de taxon | não | |||
scientificNameAuthorship | Nome do autor da espécie | Autor da Espécie | não | ||
Extensão germoplasma Darwin Core Archive | Adesão germoplasma | germplasmID | Identificador da coleção | não | |
storageCondition | Método de preservação | não | |||
Duplicata de segurança | safetyDuplicationID | Acrônimo da coleção de destino | não | ||
safetyDuplicationDate | Data de envio da duplicata | não |